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故事延续的是大坝之后的内容，训练家被抓走之后，一个其他的组织，发现了这名训练家具有一种特别的能力，能和宝可梦进行对话的同时，还能对宝可梦进行心灵控制。
所以这名训练家被卖给了黑市，又被交换到了另外一个组织，这个组织的老大正是这座城市里面的宝可梦中心的掌权者。
而这个组织在最近，又发现了一只在外太空的神秘宝可梦，于是便想要借用这个训练家的能力，看能否控制这只宝可梦。
玩家要是想要继续救回自己的训练家，就需要在这个地图里面抢夺唯一的钥匙，那个钥匙就在这张地图的boss，也就是这个城市里面的掌权者手上，。
只有击败他的宝可梦，才能获得这个钥匙，然后解救出自己的训练家。
但值得注意的是，这个任务，无论如何，不管成功与否，训练家都无法解救出来，因为在任务的最后cg，这个地图丧心病狂的boss，在见到自己大势已去之后，会告诉玩家，它们的训练家早就被关在了一个火箭发射舱里面，他一旦失败，火箭发射舱便会启动，将玩家的训练家送向外太空。
当然游戏的自由度是很高的，玩家操控的宝可梦，也不是一定要接取这个任务，可以选择自主在地图里面搜索物资，最后选择撤离，这样的撤离结果就是一个搜索线索的撤离cg。
地图的boss会将玩家的训练家带到下一个地图.....
总之后面的剧情，就是为了开展新的地图而写出来的剧情。
不过，相对于大坝是所有这个游戏玩家的新手图而言，这个叫做“航天”的城市，对于玩家来说，是有一定能量等级要求的，玩家在入图前就要花费能量币，给自己带好足够的进化石或者是能让自己实力变强的佩戴品。
而现在，拉帝亚斯操控的皮卡丘，紧张兮兮的站在一个管子的面前。
画面中的皮卡丘用电流激活一道只能由电属性属宝可梦才能开启的门后，看着眼前的管道，却是不敢前进。
无关于其他，这条管道被称为这张地图里面的死亡通道，因为附近的其他玩家刷新点实在是太多了。
一些选择飞行系宝可梦的玩家，还有一些选择炮台形宝可梦的玩家，会在出生后的第一时间，就将目光对准这里，飞行系宝可梦的玩家可以释放诸如空气之刃这般的技能，直接对
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