得到满足而大怒，调集军队准备进攻李傕，献帝派使者调解，马腾不听。
韩遂率军从金城来调解二人的纠纷，结果又与马腾联合。谏议大夫种邵、侍中马宇、左中郎将刘范策划让马腾进袭长安，自己为内应，来诛灭李傕等。
不久，马腾、韩遂率军进驻长平观，种邵等人的计划泄露，便从长安出逃到槐里。李傕派樊稠、郭汜及自己的侄子李利进攻马腾、韩遂，二人被击败，死伤一万多人。
韩遂、马腾逃回凉州，樊稠率军追击。韩遂派人对樊稠说：“天下之事反复无常难以预料，你我同乡，今天虽有些小摩擦，恐怕还会走到一起的，想和你谈一谈。”
二人于是并马拉着手臂，说笑了很久。四月，李傕下诏赦免马腾等，以马腾为安狄将军，韩遂为安羌将军。
结为异姓兄弟，甚为亲近。但后来，因部曲间的矛盾，马腾、韩遂二人成为仇敌，马腾攻韩遂，韩遂败走，又合兵还攻马腾，二人成为仇敌，韩遂杀掉了马腾的妻儿，二人连年交战。到后来曹操才派钟繇、韦端前去劝和。
建安四年（199年），曹操上表任命钟繇为侍中、代理司隶校尉，持节督关中诸军，将后方事务委托给他，特别授予他不受制度拘束的权力。
钟繇到达长安后，致信马腾、韩遂等人，为他们陈述利弊祸福，马腾、韩遂都送自己的一个儿子到朝廷为人质。
建安七年（202年），袁尚派高干、郭援率军数万，与南匈奴单于栾提呼厨泉进攻河东郡，并派使者与韩遂等关中诸将联合出兵，曹操派钟繇对抗，而钟繇派张既劝说马腾支持曹操。
马腾派马超率精兵一万多人，连同韩遂等的军队，与钟繇合击大破郭援等。献帝拜马腾为征南将军、韩遂为征西将军，允许他们开府辟召掾属。
建安十年（205年），曹操派张既征集马腾、韩遂等人击败了高干、张晟军，斩杀了反叛的卫固等人。
建安十四年（209年），韩遂派自己的女婿阎行前往拜谒[yè]曹操，曹操厚待阎行，上表朝廷授阎行为犍为太守。
阎行趁机请让他的父亲入朝任职，阎行西还见韩遂，把曹操劝韩遂入朝的话告诉他。并趁机劝韩遂归附曹操，劝他先派一个儿子入朝作为人质。韩遂说：“暂且再观望几年！”后来就派自己的儿子与阎行的父母一起入朝。
建
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