天启七年八月二十四日，朱由检在三大殿即皇帝位。
紫禁城的三大殿，自从万历二十五年被雷火焚毁以来，直到天启七年八月二十日才彻底修复完毕。短短四天之后，朱由检就要在这里举行登极仪式，对于礼官而言，可谓极大考验。
鸿胪寺官员茫然不知所措，仪式搞得匆忙凌乱，直到朱由检穿着衮冕来到建极殿，文武百官仍旧排列未定。
恰在此时，奉命前往南郊祭告的魏良卿返回禀报，朱由检大声说道：“知道了！”语气甚是严厉。
然后在一行人等拥护下，朱由检从建极殿来到中极殿，登上九级御座。
文武百官各具朝服，入丹墀内按序站立等候，鸿胪寺官员引执事官进中极殿行礼。
将要行礼时，朱由检按惯例命百官免贺、免宣表，止行五拜三叩头礼。
礼毕，鸿胪寺正官跪奏请升殿。朱由检自中门出中极殿到皇极殿，升上宝座。
一番复杂的仪式之后，正式登极称帝。
朝时天忽鸣，群臣以为大吉。
登极之后，对于朱由检来说，头一件事就是改元。
礼部拟了四个年号，朱由检看到其中之一的“崇贞”，提笔改“贞”为“祯”，定下“崇祯”年号。以明年为崇祯元年，命礼部尽快将即位诏书颁行天下。
又命礼部为大行皇帝拟谥号、庙号。以大学士施凤来为首，会同司礼监太监、工部尚书侍郎、礼工二部郎中、钦天监监正等官员，选择大行皇帝的陵墓。
这些事安排下来，朱由检察觉群臣已疲惫不堪，自己这两天也没有吃好睡好，着实感到疲倦，便结束了朝仪，回到后宫之中。
成为皇帝之后，朱由检已经可以去乾清宫居住。宫中没有人知道他的喜好，也不知道如何布置，便请朱由检亲自指点。
朱由检在乾清宫暖阁中看到天启皇帝遗物，其中多有玩好器具，为了避免给人留下玩物丧志的印象，命人尽行封存，以后陪葬先帝。
又遣人去信王府，将徐应元等王府太监唤来，带来常用物品。
终于进入皇宫，徐应元高兴不已。尤其是想到信王已是皇帝，他心中更是兴奋，认为自己的时代，已经即将到来。
见到朱由检后，徐应元安排人手按朱由检的喜好布置乾清宫，又因为一直没有得到任命，想起朱由检入宫前让王妃亲做麦饼，献言道：
“陛下是不是对宫中饮食不放心？”
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