通惠河，始建于元代，是通州与京师之间的漕运血脉，也是一条见证了诸多历史的沉默长河。
至元二十八年，为解决漕运及大都水源问题，元代著名天文学家、数学家、水利专家、仪器制造家，太史令郭守敬，向皇帝忽必烈提出了开发大都运河的规划。
史载，帝览奏，喜曰：“当速行之。”
于是复置都水监，命郭守敬以太史令职领都水监事。
至元二十九年春，运河工程动工。在郭守敬的领导下，士兵、民夫、工匠等共计两万余劳动者花了一年多时间，凿通了由通州到大都积水潭之间的运河。
至元三十年，已不久于人世的至元皇帝忽必烈自上都回到大都，路过积水潭，见其上“舳舻蔽水”，大悦，亲赐名为通惠河。
七十四年后，至正二十七年，十月。本朝太祖朱元璋向天下颁布《谕中原檄》，打出“驱逐胡虏，恢复中华”的旗号正式宣布伐元。
至正二十八年，亦即大明洪武元年，闰七月二十三日，明军抵达直沽。二十八日夜，至正皇帝妥懽帖睦尔抛弃大都，与皇太子、后妃及一百多名大臣出奔上都。八月二日，大都陷。元朝在中原的统治宣告结束，北元时代开始。
从吴王称明帝，大元改北元这年，一直到永乐皇帝朱棣决意迁都北京的几十年间，漕运一度废止，通惠河乃至整条京杭大运河也都被废弃。
元代通惠河挖通后，漕运水道一度能直通大都城中的积水潭。但宣德七年，宣宗皇帝朱瞻基改建行在城，将元大都南城墙南移至崇文门、正阳门一线，并把积水潭的大部分圈入皇城。行在城内不再通航，漕船亦不能驶入城内。
由此，通惠河或者说京杭大运河的终点，便由积水潭改为了惠通河的“头闸”也就是大通桥下。
嘉靖六年御史吴仲在巡视通仓后，上疏提出疏浚通惠河并对闸坝进行改造，得报。嘉靖七年二月，工程启动。三个月后，疏浚工作和闸坝改造工程竣工。
吴仲的疏浚工程完全依照二百三十五年前元朝郭守敬的引水路线，广收北山、西山诸水，截引沙河、榆河，使通惠河水势大盛，漕运畅通。除漕运船只不能直接进入积水潭而改泊大通桥下外，其他基本恢复了元朝时期漕运的盛况。
经过吴仲整修之后的大通桥是一座三孔石桥，桥洞为拱形，桥墩为尖形，以利分水。在四个
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