由于伊莎贝尔鲜明的个性和魅力，使人们极易过高的评价她在历史上的影响。她的业绩也许首先在于支持了哥伦布探险，然而，哥伦布的航行具有很大的偶然性，向西寻找印度新航道也许仅仅是出于哥伦布的个人判断。事实上，15世纪的欧洲处于躁动之中，贸易在不断扩大，探险活动不可避免，美洲大陆被发展只是时间的问题。
伊莎贝尔本人的婚姻影响了历史，而她给子女安排的婚姻也基于政治的考虑。她的女儿“疯女“胡安娜被嫁给了神圣罗马皇帝马克西米连之子、尼德兰君主腓力，他们的儿子卡洛斯一世(也称神圣罗马皇帝查理五世)，继承了包括西班牙、尼德兰、奥地利在内的庞大帝国。
此外，伊莎贝尔给西班牙奠定了政治统一的基础，并努力在思想上一统西班牙，但她所建立的审判制度却使西班牙境内的知识分子处于困境。从此之后的几个世纪，西欧思想文化界群星璀璨，而西班牙却一片沉寂，因为在审判制度下，任何一种与官方不一致的学说都会被视为异段，而且会受到残酷迫害，甚至是杀身之祸。在这样的社会里，很难有思想家出现。的确，她所建立的西班牙审判制度距今已有5个多世纪，被废止也有近200年了，但西班牙依然不能从它的影响中全面恢复过来。另外，由于南美和中美洲国家沦为了卡斯蒂利亚(西班牙)殖民地。这也意味着卡斯蒂利亚(西班牙)的文化和制度，包括审判制度，扩散到了这些地区。不难想象，由于西班牙的文化发展落后于西欧其他国家，因此，他们在南美的殖民统治，也落后于英国在北美的殖民统治。如果没有她，后来的西班牙也许会是一个多元化的社会。
但的确不能否认她本人对西班牙兴盛所作出的贡献。
这是历史所公认的！