下达后，萧铉、萧子岳等人都被赐死，他们的家属也受到牵连被杀。随后，明帝又派军队围攻担任江州刺史的晋安王萧子懋、担任荆州刺史的随王萧子隆，萧子懋、萧子隆兵败被杀，他们的亲信也都被诛杀。
建武三年（496年），明帝又杀掉了高帝的儿子湘东王萧子建、南郡王萧子夏等人，武帝的儿子建安王萧子真、巴陵王萧子伦等人。凡是高帝、武帝的子孙，无论年纪大小，都被杀害，前后一共有几十人。
巴陵王萧子伦当时只有十六岁，镇守琅琊。明帝派中书舍人茹法亮送毒酒给他。萧子伦整理好衣服帽子，出来接见茹法亮，笑着说：“前朝（刘宋）就是因为皇族自相残杀，才让我们萧家得了天下，现在这样的事情发生在我身上，也是理所当然的。你是我们家的老臣，现在奉皇帝的命令而来，我不敢违抗。”说完就喝下毒酒死了，身边的人都忍不住哭了起来。
明帝听说萧子伦的事情后，虽然有点后悔，但为了巩固自己的皇位，还是没有停止屠杀皇族。高帝萧道成曾经说过：“宋氏皇族骨肉相残，所以我才能得到天下，我们萧家不能再这样做了。”但明帝屠杀皇族的残酷程度，比刘宋还要严重，南齐的皇族几乎被斩尽杀绝。
第四节魏师南侵，明帝御敌
就在明帝屠杀皇族的时候，北方的北魏孝文帝已经迁都洛阳，推行汉化改革，国家实力越来越强，孝文帝想要南下攻打南齐，统一全国。
建武二年（495年）正月，北魏孝文帝拓跋宏亲自率领三十万大军，分三路南下攻打南齐：东路军队攻打钟离，中路军队攻打义阳，西路军队攻打南郑。
消息传到建康，明帝非常惊慌，立刻召集大臣们商量抵抗的办法：“北魏三十万大军南下，势不可挡，钟离、义阳都很危险，大家有什么好计策吗？”
太尉陈显达站出来说：“陛下，北魏军队虽然人多，但他们长途跋涉，已经很疲惫了，而且他们不熟悉水战。我愿意率领五万大军，驰援义阳，死守城池；再派崔慧景防守钟离，张冲防守南郑，分兵抵抗，一定能打败北魏军队！”
明帝非常高兴：“陈爱卿是国家的栋梁，我就任命你为征南大将军，统领各路军队，抵抗北魏入侵！”
陈显达率领大军赶到义阳，和北魏将领元英展开激战。元英率领北魏军队猛攻义阳，陈显达坚守城池，
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