幕府太政大臣要求他们一起辅佐，自己的幼子：丰臣秀赖，其根本目的是要以合议制度来抑制幕府内大臣的抬头，以确保丰臣政权可以代代相传。
8月18日，交代完后事之后幕府太政大臣：丰臣秀吉，便在京都伏见城死去。
同时明水师提督还派遣战船数百艘，分布于忠清左右道、全罗左右道、庆尚左右道，等重要海口严防倭军。
9月11日，明备倭总兵再次包围幕府第一军左副将于蔚山都护府，两军互有胜负，但最后却遭到幕府左近将监兼侍从：立花宗茂，的后续援军赶来救援，先以千人夜袭明军后，在以假营伏兵攻击追来的明军使其败退。
10月初2日，幕府太政大臣于8月18日死于京都伏见城的消息传至李氏朝鲜王国，让前线的倭军将领们士气因而受挫，又接到五大老与五奉行的命令开始撤退，由幕府第一军左副将首先下令乘船撤退。
随后明备倭总兵让明军追击幕府第一军左副将，并火器优势取得胜利。
10月11日，西路的明御倭副总兵、东路的明备倭总兵，两路明军进展都比较顺利，而中路的明中军都督府左都督率兵3万人攻打倭军新起的泗川县城寨时，由幕府第五军下参议率7千兵力驻守。
由于明军火炮营在布阵后，中军都督府士兵皆是南直隶中都留守司附近驻军，素不习战，亦不太擅长火器，明军火炮手先以大将军炮、攻戎炮，等火炮打破泗川县大门一扇、城垛数处。
之后又发各类火器，在点火时的有些火炮突然炸膛，并引起了大营火药库的连番爆炸，硝烟掩盖半边天，全军上下顿时乱成一片。
这时幕府第五军下参议一看明军大营发生爆炸，随即命令倭军出击，混乱中的明军大乱，倭军从前小门杀出，直冲中军都督府明军，导致中军都督府各路卫所明军皆被屠杀溃走，三千中军都督府士兵，战后止存五、六十人，是为〈泗川之战〉。
11月17日，留守的各路倭军无心恋战，打算由蔚山都护府撤退，明军分道进击。
就在倭军将领撤退之时，明水师提督：陈璘，派遣明水师左参将：邓子龙，偕同李氏朝鲜三道水军统制使：李舜臣，联合出击，在露梁海上截击想援救幕府第二军右副将：小西行长，的援军幕府左近将监兼侍从：立花宗茂、幕府第五军下参议：岛津义弘、
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