然而满清皇父摄政王却以西洋历法与实际天象符合的程度，远胜过传统的历法为由，拒绝了吴、杨等人的讦告，因此清初历法之争，暂告一段落。
就在满清皇父摄政王大刀阔斧的改革新政之时，满清贵族统治集团们也强制推行了『圈地之争』，并上奏满清皇父摄政王得到了认可。
随后满清皇父摄政王便立即下令，圈占官民田地，全部分与八旗王公大臣和八旗兵丁，又在各地设立皇庄、王庄、八旗官员庄田，这项政策使得老百姓离其田园，别其坟墓，造成妇子流离，哭声满路的悲惨景象。
把原来京师附近军民们的田产以及家产全部划分为满清八旗子弟固有资产，这就引发了京师周边军民们的第二波起义。
紧接着还有〈缉逃人〉也就是所谓的逃人法，把原本俘虏的奴隶以及穷苦人，全部作为满清八旗子弟的佣人禁止他们逃走，违令者悬赏缉拿，并以屠城手段作为民族奴役、民族压迫的措施。
这就激起了第三波，汉族各阶层人士们一场持续广泛，且有组织的民族抵抗运动。
其中一部分大明遗民和其他地主阶级，及其知识分子们，均标榜〔君亲之尊〕、｛华夏之防｝，并打着恢复（大明江山）的旗号，披发跣足，奔走呼号，掀起了重要波澜。
在配合着满清剃发易服令的双管齐下，从而演变成了清初历史上著名的反清复明运动起因。
不过随着反清斗争的深入，复明运动的目地，却有着很大的不同，如一部分地主、官僚们哭祭大明崇祯帝，声称要相随明太祖吴王高皇帝恢复朱明皇帝的统治。
但是另一部分地主缙绅、前明士大夫们，却不是一般地倡言封建纲常、死心塌地忠于一家一姓、如何的眷恋大明统治。
而是首先在反对满族贵族统治集团的民族奴役和民族压迫措施中，先主张恢复汉族地主的统治，之后再选出一家当天下之主。
然而伴随着满清八旗子弟、王公贵族们在各地圈占土地，建立庄园。
这些庄园自然也要有大量的人力去劳动，毕竟满清满族贵族们自己可不愿意干农活，也不太会干农活，因此他们就把失去土地，成为流民的老百姓们，又抓到庄园里去劳动，史称「圈地投充」。
而这些被投充到庄园里劳动的汉族人民们，实际上就成为了奴隶，被满清贵族们叫做（包衣奴才）。
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