阳讨伐董卓。董卓派遣一支疑兵正面进攻，假装要从平阴渡过黄河，又暗中调集精锐部队悄悄从洛阳北面的小平津北渡黄河，绕到王匡军队后面，出其不意地发起攻击。王匡的军队在河阳津北被打得大败，几乎全军覆没。
崤山以东地区各州郡纷纷起兵讨伐董卓，董卓心中恐惧。初平元年（公元190年）二月，董卓让汉献帝及公卿百官离开洛阳，迁都长安。
汉献帝的车驾离开后，董卓又下令纵火焚烧洛阳的宫殿，烧毁官舍、民房无数；董卓又将历代皇帝陵墓挖开，掠夺陵墓中的殉葬宝物。
次年，长沙郡太守孙坚进兵阳人，董卓派遣部将胡轸、吕布攻打孙坚，反被孙坚击败。
董卓畏惧孙坚勇猛，派遣部将李傕拜访孙坚请求和谈，遭到拒绝。孙坚率军在洛阳附近进攻董卓，董卓败走，放弃洛阳。
初平二年（公元191年）四月，董卓率兵抵达长安，自任太师，号称“尚父”，他所使用的车驾服饰等，都与天子无异。
董卓又任命弟弟董旻为左将军，封鄠侯；他兄长的儿子董璜，兼任侍中、中军校尉，负责指挥京城的防守军队；董氏宗族及亲属，全都在朝廷担任要职。
公卿大臣见到董卓，都要在他的车驾前跪拜行礼，董卓则不予还礼；他还传令尚书台、御史台、符节台及以下官员，前往其府中禀告公事。
董卓又在长安城外修筑郿坞，储藏的粮食足够吃三十年。有一次他去郿坞视察，公卿百官在长安城横门外为他设宴饯行。
董卓事先命令部下搭起帐篷，与群臣饮宴。席间，董卓命侍卫将北地郡反叛而被诱降的士兵数百人押解上来，就在席间当众割去舌头、砍断手足，公卿大臣无不被眼前惨状吓得浑身发抖，董卓却饮食如故，若无其事。
董卓擒获崤山以东诸侯讨伐他的义兵，就用涂满猪油的布匹将士兵的身体裹上，然后点火焚烧，先从脚开始烧起。
董卓又抓获袁绍部下豫州从事李延，用大锅将其煮杀。董卓所宠幸的胡人，恃宠放纵，多次犯法，被司隶校尉赵谦所杀，董卓大怒，但又敬畏赵谦，没有加罪，反而派人将司隶都官杀死。
故太尉张温素来不喜欢董卓，董卓也憎恨于张温，于是假借天象有变，诬告张温与袁术勾结谋反，用鞭杖将张温活活打死。
董卓法令严酷，纵容诬告，彼此牵连
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