董卓得知后，率军前往京城北郊的北邙山迎接皇帝，刘辩见到董卓的军队非常害怕，甚至不能与董卓对话；
陈留王刘协将宦官作乱的事情告诉了董卓。董卓认为刘协更加贤能，而且是董太后抚养长大，董太后与董卓又是同宗，董卓于是有了废立皇帝的想法。
董卓护送少帝等人返回皇宫，当时何进的弟弟车骑将军何苗也在京城动乱时被杀，何进与何苗统率的军队失去主将，无所适从，于是全都归附了董卓。
董卓又指使吕布杀死负责京城治安的执金吾丁原，吞并丁原的部队。因此，整个京城的兵权都集中在董卓一个人手里。
当时，国内遇到大旱，很久没有下雨。董卓以此为借口，逼迫少帝下诏罢免司空刘弘，自己取而代之。
董卓控制朝廷的军队和朝政大权后，提出废立皇帝，群臣都不敢反对。董卓于是废黜少帝刘辩为弘农王，将何太后迁居永安宫；
不久，董卓害死弘农王刘辩，又鸩杀何太后。董卓改立陈留王刘协为帝，是为汉献帝；
此后，董卓升任太尉，被授与节杖、黄钺和虎贲卫队，兼任前将军，晋爵为郿侯。
不久，董卓自任为相国，入朝不拜，剑履上殿，又封他的母亲为池阳君，并且为她设置了家令、丞等下属官员。
董卓掌权之后，在洛阳胡作非为，他纵容士兵抢劫王室宗族、豪门高官，又派人挖开汉灵帝埋葬的文陵，取走陵墓中的珍宝。董卓由滥用刑罚，睚眦必报，以致群臣畏惧不安。
此外，董卓还曾派部下到洛阳东南的阳城县巡查，恰逢民间二月祭祀土地神的日子，百姓云集，进行祭祀活动。
董卓的军队冲入人群，将在场的男子统统砍杀，又抢走百姓的车和牛，把妇女和财物装上车，砍下的首级则系在车辕和车轴上，驱赶牛车返回洛阳，谎称进攻贼寇获胜。
当初，董卓信任尚书周毖、城门校尉伍琼等人，任用他们举荐的韩馥、刘岱、孔伷、张咨、张邈等人，离开京城前往各州郡担任刺史或太守等职。
初平元年（公元190年），韩馥、刘岱等人到任，与袁绍、曹操等人结为联盟，纷纷举义兵讨伐董卓。
董卓听说韩馥、刘岱等人反叛，认为周毖、伍琼与韩馥等人串通勾结，出卖自己，于是诛杀周毖与伍琼两人。
当时，河内郡太守王匡屯兵在河阳津，准备进兵洛
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